關于印發(fā)《關于進一步加強科學事業(yè)單位內部控制建設的指導意見》的通知
財會〔2025〕30號
黨中央有關部門，國務院有關部委、有關直屬機構，最高人民法院，最高人民檢察院，有關人民團體，各省、自治區(qū)、直轄市、計劃單列市財政廳（局）、科技廳（委、局），新疆生產建設兵團財政局、科技局，有關單位：
為貫徹落實《中華人民共和國會計法》和中央辦公廳、國務院辦公廳印發(fā)的《關于進一步加強財會監(jiān)督工作的意見》有關要求，推動科學事業(yè)單位進一步加強內部控制建設，促進科研水平提升，我們制定了《關于進一步加強科學事業(yè)單位內部控制建設的指導意見》，現(xiàn)予印發(fā)，請各級各類科學事業(yè)單位遵照執(zhí)行，其他科研項目承擔單位涉及科研活動內部控制的參照執(zhí)行。
財政部 科技部
2025年11月21日
關于進一步加強科學事業(yè)單位內部控制建設的指導意見
科學事業(yè)單位是國家科技創(chuàng)新體系的重要組成部分，承擔著基礎研究、技術攻關及成果轉化等核心職能。為貫徹落實《中華人民共和國會計法》和中央辦公廳、國務院辦公廳印發(fā)的《關于進一步加強財會監(jiān)督工作的意見》有關要求，推動科學事業(yè)單位加強內部控制建設，提高科研管理能力，促進科研水平提升，現(xiàn)提出如下意見。
一、總體要求
以習近平新時代中國特色社會主義思想為指導，深入貫徹黨的二十大和二十屆歷次全會精神，全面規(guī)范科學事業(yè)單位的經濟活動和科研活動，建立健全科學有效的內部制約機制，有效防控科學事業(yè)單位經濟活動和科研活動有關風險，全面提升科學事業(yè)單位內部管理能力和科研水平，為推動科學事業(yè)單位高質量發(fā)展、深入實施科教興國戰(zhàn)略提供有力支撐。
──堅持黨的領導。充分發(fā)揮黨的全面領導政治優(yōu)勢，把黨的領導落實到科學事業(yè)單位內部控制建設、實施與評價監(jiān)督的全過程，確保黨中央、國務院重大決策部署有效貫徹落實。
──堅持統(tǒng)籌推進?？茖W事業(yè)單位內部控制要確保覆蓋各項經濟活動和科研活動，貫穿決策、執(zhí)行、監(jiān)督全過程，與各類監(jiān)督有機貫通協(xié)調，實現(xiàn)對經濟活動和科研活動的高效管理。
──堅持風險導向。聚焦科學事業(yè)單位重點經濟活動和科研活動等高風險領域，查找風險隱患并設置風險清單，建立健全風險評估機制，提出風險應對措施，完善內部控制制度、標準和流程，建立長效機制，突出重點，講求實效，切實提高內部控制工作的針對性和有效性。
──堅持動態(tài)優(yōu)化。科學事業(yè)單位內部控制建設應當符合國家有關法律法規(guī)規(guī)定、科學事業(yè)單位發(fā)展的實際情況和科學研究的客觀規(guī)律，并隨著外部環(huán)境的變化、科學事業(yè)單位經濟活動和科研活動的調整以及管理要求的提高，不斷優(yōu)化完善內部控制，建立健全科學有效的內部控制體系，推動合規(guī)與放權并重，適應新時代的需求。
到2027年，基本建立健全權責清晰、制衡有力、運行有效、監(jiān)督到位的內部控制體系，嚴肅財經紀律，合理保證科學事業(yè)單位經濟活動和科研活動合法合規(guī)、資產安全和使用有效、財務信息真實完整，有效預防腐敗與科研失信行為，提高科研資源配置水平和使用效益，支持科學事業(yè)單位高質量發(fā)展。到2035年，各科學事業(yè)單位內部控制體系更加健全，內部控制推動單位科研能力提升更加有效，為建設科技強國奠定堅實基礎。
二、主要任務和措施
?。ㄒ唬┏掷m(xù)優(yōu)化科學事業(yè)單位內部控制環(huán)境。
1.建立健全科學事業(yè)單位內部控制領導機制。充分發(fā)揮科學事業(yè)單位黨組織在內部控制建設中的領導作用，內部控制相關重要議題應提請黨組織決策審議。明確科學事業(yè)單位主要負責人是內部控制建設和實施工作的首要責任人，明確領導班子其他成員作為各自分管領域內部控制建設與實施的負責人，將內部控制工作納入領導班子年度履職清單。
2.建立健全科學事業(yè)單位內部控制工作機制。成立內部控制領導小組，明確內部控制建設的牽頭部門和監(jiān)督評價部門，監(jiān)督評價部門應當與建設牽頭部門相互分離；科學事業(yè)單位內部各部門是本部門內部控制建設和實施的責任主體，部門負責人對本部門的內部控制有效性負責。
3.建立健全科學事業(yè)單位內部控制制衡機制。完善科學事業(yè)單位議事決策機制，明確“三重一大”事項的具體內容和標準，嚴格履行“三重一大”事項集體決策程序；強化內部控制關鍵崗位責任制，制定關鍵崗位職責清單，確保不相容崗位相互分離；實行內部控制關鍵崗位輪崗制度，明確輪崗周期，對不具備輪崗條件的崗位應當采取專項審計等控制措施；加強內部授權審批控制，明確各崗位辦理業(yè)務和事項的權限范圍、審批程序和相關責任；明確定期對會計資料進行內部審計的辦法和程序。
4.合理制定科學事業(yè)單位發(fā)展規(guī)劃。按照黨中央和國家關于科技改革發(fā)展的方針政策和決策部署要求制定單位自身的發(fā)展規(guī)劃；加強對發(fā)展規(guī)劃實施情況的評估，根據實際需要對發(fā)展規(guī)劃作出調整的，應當按照規(guī)定予以調整。
5.強化科學事業(yè)單位內部控制文化建設。定期組織科學事業(yè)單位領導班子和科研人員學習內部控制知識，開展內部控制典型案例的學習交流，創(chuàng)新方式方法，提高全體科研人員對科研領域共性風險及單位個性風險的認識，持續(xù)營造全員參與建設內部控制的良好氛圍。
6.加強科學事業(yè)單位內部控制人才隊伍建設。鼓勵設立內部控制工作崗位，配備專職工作人員。通過交流研討、專題培訓、案例教學等方式，提升科學事業(yè)單位內部控制崗位人員的專業(yè)技能和綜合素質，為內部控制建設提供人力資源保障。
（二）穩(wěn)步推進科學事業(yè)單位風險評估工作。
7.健全完善定期風險評估機制。成立風險評估工作小組或明確開展風險評估的實施部門，至少每年組織一次風險評估，明確風險點，分析風險發(fā)生可能性和風險影響程度，確定風險清單，形成書面風險評估報告；充分關注內外部環(huán)境變化對風險評估的影響，當外部環(huán)境、經濟活動、科研活動或管理要求等發(fā)生重大變化時，及時對經濟活動和科研活動的風險重新進行評估。可根據需要聘請具有專業(yè)勝任能力的第三方機構開展風險評估工作。
8.強化科學事業(yè)單位重點經濟活動和科研活動的風險評估。在開展單位層面風險評估的基礎上，加強預算、收支、采購、資產管理、建設項目、合同管理等經濟活動，以及科研活動重點領域的風險評估工作。定期或不定期向科學事業(yè)單位領導班子報送風險評估結果。
9.重視科學事業(yè)單位風險評估結果應用與風險應對措施。在全面分析科學事業(yè)單位內外部環(huán)境、管理現(xiàn)狀和風險管理水平的基礎上，運用風險規(guī)避、風險降低、風險分擔和風險承受等風險應對策略，通過不相容崗位相互分離、授權審批、歸口管理、預算控制、財產保護控制、會計控制、單據控制、信息內部公開等控制方法，實現(xiàn)對風險的有效控制。
（三）健全完善科學事業(yè)單位經濟活動內部控制措施。
10.加強預算管理。認真落實科學事業(yè)單位的預算管理主體責任，建立健全包括科研資金在內的預算編制、審批、執(zhí)行、決算與績效管理等預算內部管理制度，明確各部門在預算管理中的職責和權限，實施動態(tài)監(jiān)管，確保經費合理規(guī)范使用。將零基預算理念全面引入預算管理，打破支出固化僵化格局。規(guī)范項目預算編制，確保項目預算與任務、項目目標與經費相匹配。建立健全預算評估評審工作機制，重點加強對項目預算的目標相關性、政策相符性、經濟合理性的審核。強化預算剛性約束，堅持“無預算不支出”原則。建立預算編制、執(zhí)行中的溝通協(xié)調機制，加強資源統(tǒng)籌，聚焦單位戰(zhàn)略規(guī)劃和工作計劃。落實全過程預算績效管理，加強事前績效評估、績效目標管理、績效監(jiān)控、績效評價及結果應用。
11.強化收支管理。健全收入內部管理制度，依法依規(guī)組織各類收入，規(guī)范各類收費事項，保證收入完整，各項收入應全部納入單位預算，及時入賬，統(tǒng)一核算、統(tǒng)一管理。健全票據管理制度，明確各類票據的申領、啟用、核銷、銷毀等程序和手續(xù)。完善項目經費收支管理辦法和各關鍵崗位的職責權限，明確項目負責人是項目經費管理的直接責任人。明確各類支出的關鍵控制點，按照相關規(guī)定開展成本核算；貫徹落實改進完善財政科研項目資金管理等有關政策，建立健全科研人員出國（境）、業(yè)務性會議、培訓費、差旅費、勞務費及咨詢費等管理辦法，做到“厲行節(jié)約，反對浪費”。按要求提取間接費用，完善間接費用的內部管理辦法。包干制科研經費嚴格遵循包干使用、權責統(tǒng)一的原則，細化明確經費使用負面清單，強化事前承諾與事后公示機制。堅決杜絕套取資金、虛報冒領相關費用、違規(guī)列支科研經費等行為，堅決杜絕制度外收支和“小金庫”，嚴禁與合作對象間違規(guī)利益輸送，規(guī)范項目結余資金管理，健全結余資金盤活機制，減少資金沉淀。建立健全債務內部管理制度，完善隱性債務風險管控機制，嚴禁違規(guī)違法舉債，及時對賬和清償債務，防范和控制財務風險。健全印簽（含密鑰、數字證書）管理制度，明確各類印簽（含密鑰、數字證書）的制作、啟用、保管、銷毀等程序和手續(xù)。
12.加強采購管理。建立健全采購內部控制管理制度，明確職責劃分與歸口管理；落實國家對科研設備、耗材的采購政策；科學劃分貨物、工程和服務采購項目，根據采購項目特點選擇適宜的采購方式，確定采購過程中的關鍵管控環(huán)節(jié)，細化采購執(zhí)行中需求管理、政策落實、履約驗收、信息公開等重點環(huán)節(jié)的控制措施。對采購限額標準以上的對外委托業(yè)務應執(zhí)行政府采購有關規(guī)定。
13.強化資產管理。健全資產內部管理制度，明確相關部門和崗位的職責權限，強化對配置、使用和處置等關鍵環(huán)節(jié)的管控；按規(guī)定程序和標準配置資產，強化流動資產、固定資產和無形資產等的管理和利用；落實定期清查盤點與報告制度；規(guī)范資產出租出借和處置，推動大型科研儀器設備等資產共享共用，建立健全收費制度，推動低效運轉、閑置資產通過多種方式盤活利用，運用全國行政事業(yè)單位國有資產調劑共享平臺開展資產調劑、共享工作。
14.加強對外投資及所屬單位管理。嚴格控制對外投資，明確對外投資的可行性評估和集體決策機制；明確對外投資的可行性研究與評估、決策與執(zhí)行、處置等各環(huán)節(jié)的控制措施；加強對投資項目的追蹤管理，建立責任追究制度。強化所屬單位管理，明確所屬單位的職能定位和權限，建立健全對分支機構、下設企業(yè)、掛靠非營利機構等所屬單位的管理體制機制；采取切實有效措施履行國有資產監(jiān)管職責，維護國有資產權益，健全國有資產管理監(jiān)督機制，防止國有資產流失。
15.加強建設項目管理。建立健全建設項目內部管理制度、議事決策機制和審核機制；完善建設項目全生命周期控制，按規(guī)定程序編制建設項目總體規(guī)劃及各類申報、審批文件，規(guī)范項目必要性和可行性的研究與論證、投資控制與概預算管理、招標、項目施工與價款支付、竣工驗收與決算、項目檔案管理等；建設項目竣工驗收合格后應及時辦理資產交付手續(xù)，并依據批復的項目竣工財務決算調整賬務。加強維修改造基本建設項目過程管理；加強對科研用房等建設項目后續(xù)使用效益的監(jiān)督評估，強化建設資金的投入產出比分析，切實提升科研建設項目資金的使用效益。
16.完善合同管理。健全合同內部管理制度，明確合同管理歸口部門及各類型合同的具體管理部門；明確對合同進行審查的責任部門、相關內容和標準；規(guī)范各類合同的分級分層審批流程、簽署權限及程序，加強合同訂立、合同用印、合同變更、合同付款、合同驗收、合同歸檔等全過程管理；強化對合同履行情況的跟蹤和監(jiān)控，建立合同臺賬或合同管理信息系統(tǒng)及清理處置機制，確保合同全面有效履行。
17.加強財政專項項目管理。規(guī)范立項程序，做好項目評審，建立項目庫動態(tài)管理機制，嚴格按財政專項資金管理辦法要求用好資金，加強對項目實施過程監(jiān)控，依規(guī)履行項目變更審批手續(xù)，建立項目全過程績效管理機制。
?。ㄋ模┩苿蛹訌娍茖W事業(yè)單位科研活動內部控制措施。
18.加強科研項目分類管理。建立健全針對不同類別科研項目的管理制度和組織實施機制，明確各類科研項目的支持方向、經費使用范圍、績效目標考核機制等內容。
19.規(guī)范科研項目全過程管理。加強項目立項遴選和審查機制；合理設計項目、課題結構，科學設置項目成果指標；明確項目實施過程的管控要求和職責權限，及時報告項目中期或年度執(zhí)行、經費到位及使用情況等；建立健全項目中期檢查制度，建立督導、限期整改、暫停項目實施等整改措施制度；完善信息公開制度，在符合保密管理要求的前提下，在單位內部公開項目立項、主要研究人員、資金使用（包括外撥資金、結余資金）、大型儀器設備購置以及項目研究成果等情況；完善項目驗收準備工作操作指南，全面梳理項目執(zhí)行情況、經費管理使用情況，切實落實科技報告等成果管理、檔案管理、經費審計等方面的具體要求。堅持科研項目及其經費管理“放權”與“合規(guī)”并重，強化科研項目經費的監(jiān)督檢查，動態(tài)監(jiān)管經費使用并實時預警提醒，確保經費合理規(guī)范使用。
20.加強科研成果管理。建立學術論文發(fā)表誠信承諾制度、科研過程可追溯制度、科研成果報告制度等成果管理制度。建立健全技術轉移工作體系和機制，完善科技成果轉移轉化管理制度，明確科技成果轉化各項工作的責任主體，建立健全科技成果轉化重大事項領導班子集體決策制度，優(yōu)化科技成果轉化流程，明確科技成果定價機制，建立健全轉化科技成果收益分配制度和激勵制度；建立轉化過程的動態(tài)監(jiān)督機制，嚴肅懲戒成果轉化過程中的失信或泄密行為。建立健全知識產權管理制度和機制建設，強化全過程知識產權管理，建立有效的知識產權收益激勵機制；建立科研人員職務科技成果管理制度，完善知識產權合規(guī)使用程序，健全知識產權風險管理制度，建立知識產權糾紛處理機制。
21.明確科研項目負責人直接責任。強化科研項目負責人直接責任意識，壓實項目執(zhí)行責任、經費使用責任，嚴格履行科研合同義務，嚴禁違規(guī)將科研任務轉包、分包他人，嚴守科研倫理規(guī)范，守住學術道德底線。
22.加強科學數據管理。建立科學數據質量控制體系和科學數據保存制度，加強科學數據分級分類管理，明確科學數據的密級和保密期限、開放條件、開放對象和審核程序等；建立健全涉及國家秘密的科學數據管理與使用制度，加強科學數據全生命周期安全管理。
23.健全科研誠信管理。切實履行科研誠信建設的主體責任，將科研誠信工作納入常態(tài)化管理，建立科研活動全過程的科研誠信監(jiān)督機制，加強科研誠信教育培訓。建立健全教育預防、科研活動記錄、科研檔案保存等各項制度，明晰責任主體，完善內部監(jiān)督約束機制。制定完善違背科研誠信要求行為的查處、通報和信息共享機制，將嚴重失信行為納入單位內部失信記錄并報送上級主管部門和所在地省級科學技術行政部門納入科研誠信嚴重失信行為數據庫，依法依規(guī)實施限項申報、限制評獎評優(yōu)及職稱職務晉升等失信懲戒措施。
24.加強科技倫理管理。履行科技倫理管理主體責任，建立常態(tài)化工作機制，加強科技倫理日常管理，主動研判、及時化解本單位科技活動中存在的倫理風險。根據實際情況，設立本單位的科技倫理（審查）委員會。健全科技倫理監(jiān)管機制和審查質量控制、監(jiān)督評價機制，經常性開展單位工作人員科技倫理教育培訓，加強對納入清單管理的科技活動的動態(tài)跟蹤和倫理風險防控。
25.規(guī)范科研項目評審與人才評價管理。完善項目發(fā)布機制，建立公正、科學、明確的項目評審工作規(guī)則，完善評審專家選取使用機制，嚴格項目成果評價驗收和績效評估，加強對項目成果的真實性審查。堅持評用結合，健全科技人才評價組織管理，根據實際建立人才分類評價指標體系，突出崗位履職評價，完善內部監(jiān)督機制，并注重發(fā)揮同行評議機制在人才評價過程中的重要作用。
26.加強合作科研與兼職人員管理。合作科研須按照合同管理的有關要求簽訂書面合同或協(xié)議，明確知識產權歸屬、成果轉化收益機制及保密義務，根據協(xié)議完成認定登記，并納入單位科研項目備案系統(tǒng)，確保法律效力；加強對外撥經費的審查，確保合作單位與項目的相關性以及關聯(lián)交易的真實性、必要性、公允性，強化對外撥經費形成科研成果的驗收審查力度，杜絕以合作名義謀取非法利益；重點監(jiān)管國內外項目合作與交流，推行科研人員涉外活動備案制度，防范知識產權流失。明確兼職的權利、義務、審批流程管理、取酬管理等內容，實行科研人員兼職公示制度，兼職協(xié)議須約定本職優(yōu)先原則、保密義務及利益沖突回避等關鍵條款。
27.完善學術交流管理。規(guī)范科研人員參加國內外學術交流活動的管理流程，強化對學術交流內容、渠道及成果的審核或備案。明確學術會議、技術論壇、合作訪問等學術交流形式的審批權限和責任主體，建立事前申報、事中監(jiān)管、事后評估的全過程管理制度。涉外交流項目應嚴格執(zhí)行國家相關規(guī)定，落實外事紀律和保密要求，防范技術泄露與利益沖突風險。
?。ㄎ澹┲鸩教嵘茖W事業(yè)單位內部控制的信息化水平。
28.充分利用信息化技術手段，加強科學事業(yè)單位內部控制建設，注重減輕基層負擔，逐步實現(xiàn)管理制度化、制度流程化、流程表單化、表單信息化、信息智能化的建設要求。
29.推進內部控制建設融入科學事業(yè)單位業(yè)務系統(tǒng)。將崗位職責、業(yè)務標準、制度流程以及控制措施嵌入各項業(yè)務系統(tǒng)中，通過系統(tǒng)予以固化，確保各項業(yè)務活動可控制、可追溯，有效防范違規(guī)操作。
30.加強科學事業(yè)單位信息系統(tǒng)平臺化、集成化建設。做好統(tǒng)籌規(guī)劃，減少重復浪費，積極探索打通各類信息系統(tǒng)之間的壁壘，在滿足網絡安全和保密管理的前提下，保障科學事業(yè)單位信息系統(tǒng)互聯(lián)互通、信息共享，實現(xiàn)各類經濟活動及相關業(yè)務活動的資金流、實物流、信息流、數據流有效匹配、順暢銜接。
31.加強科學事業(yè)單位網絡安全與數據安全建設。深入貫徹信息安全登記保護、涉密系統(tǒng)分級保護、數據安全監(jiān)理要求，加強身份鑒別與授權應用，鼓勵嵌入實時監(jiān)控和預警模塊，建立數據分類分級保護制度，保障網絡信息存儲安全，以及數據的產生、傳輸和使用過程中的安全，防止內部信息泄露，做好網絡安全防護。
?。娀茖W事業(yè)單位內部控制評價與監(jiān)督。
32.開展內部控制評價。定期對內部控制體系建立與實施情況進行自我評價，科學評價內部控制的有效性，形成評價報告?？筛鶕枰刚埦哂袑I(yè)勝任能力的第三方機構開展內部控制評價工作，提供內部控制建設服務的第三方機構不得同時為同一科學事業(yè)單位提供內部控制評價服務。
33.加強內部控制評價結果應用。推動將內部控制評價結果作為職稱評定、績效管理、監(jiān)督問責等工作的重要依據，提高廣大科研人員對內部控制的重視程度。對內部控制評價中所發(fā)現(xiàn)的問題，要落實整改責任，及時制定整改措施，完善內部控制制度，實現(xiàn)內部控制工作閉環(huán)管理。
34.完善內部控制監(jiān)督的聯(lián)動機制。進一步加強科學事業(yè)單位財會監(jiān)督工作，將內部控制建立、實施與評價情況與巡視巡察、財會監(jiān)督、內部審計、紀檢監(jiān)察等其他監(jiān)督機制有效聯(lián)動，充分利用黨和國家各項監(jiān)督體系成果，形成監(jiān)督合力。
35.報送內部控制報告。按照財政部門和上級主管部門要求，及時、完整、準確報送內部控制報告，加強內部控制報告審核工作，提高內部控制報告質量。
三、保障措施
?。ㄒ唬┘訌娊M織領導。各級財政部門、科學技術行政部門和科學事業(yè)單位主管部門等要發(fā)揮統(tǒng)籌協(xié)調作用，加強對科學事業(yè)單位內部控制建設的政策指導和督促，確?？茖W事業(yè)單位內部控制建設有效落地。
?。ǘ┳ズ秘瀼芈鋵崱？茖W事業(yè)單位要按照本指導意見確定的總體目標和主要任務，結合本單位實際情況，制定工作方案或制度辦法、實施細則，明確任務分工，健全工作機制，加大保障力度，層層壓實責任，充分利用信息化手段，積極推動內部控制在本單位的落地見效。
（三）強化監(jiān)督檢查。各級財政部門、科學技術行政部門和科學事業(yè)單位主管部門要按照各自職責分工，加強對科學事業(yè)單位內部控制建立與實施情況的監(jiān)督檢查，針對檢查中發(fā)現(xiàn)的內部控制問題和薄弱環(huán)節(jié)，督促科學事業(yè)單位及時制定整改措施，建立長效機制，持續(xù)優(yōu)化內部控制體系。加強監(jiān)督檢查結果應用，推動內部控制與預算分配、獎懲機制、責任追究等掛鉤，推進內部控制體系在科學事業(yè)單位內部見行見效。
?。ㄋ模┘訌娦麄饕龑?。各級財政部門、科學技術行政部門、科學事業(yè)單位主管部門和各科學事業(yè)單位要加大宣傳教育力度，加強政策指導及業(yè)務培訓，廣泛宣傳內部控制建設的必要性和重要意義，積極推廣內部控制建設的先進經驗和典型做法，引導科學事業(yè)單位廣大干部職工自覺提高風險防范和權力規(guī)范運行意識，為全面推進科學事業(yè)單位內部控制建設營造良好的環(huán)境和氛圍。
